本站消息 近日，中国科学院西双版纳热带植物园郁文彬研究员团队和云南农业大学董扬教授团队在国际综合性期刊scientific data（JCR Q1,IF5 years=8.9）上联合发表了题为“Chromosome-level and haplotype-resolved genome assembly of Dracaena cambodiana (Asparagaceae)”与“Chromosome-level genome assembly and annotation of Flueggea virosa (Phyllanthaceae)”的系列研究论文。两个研究团队利用全基因组测序和生物信息学分析方法，构建了柬埔寨龙血树与白饭树染色体水平的基因组，为这两种特色药用植物未来的分子研究与功能基因组学研究提供了重要的基因组数据资源。
柬埔寨龙血树（D. cambodiana Pierre ex Gagnep.）作为生产龙血竭的基原植物之一，具有重要的经济价值，已被列为国家二级重点保护野生植物。然而，野生资源过度采伐和自然栖息环境的退化，导致其种质资源日趋枯竭。为此，研究团队成功组装了染色体水平柬埔寨龙血树单倍体（Haplotype）基因组，单倍体A和单倍体B，大小分别为1,015.22 Mb和1,003.13 Mb。使用“embryophyta_10”数据集对其进行完整性评估，单倍体A和单倍体B基因组的完整性分别为98.60%和98.20%。基因注释结果显示单倍体A和单倍体B基因组分别包含27,361和27,066个蛋白质编码基因。
叶下珠科（Phyllanthaceae）白饭树（Flueggea virosa (Roxb. ex Willd.) Baill.）以其白色果实酷似煮熟的白米饭而得名，其广泛分布于热带非洲、东亚和东南亚以及大洋洲。当前，叶下珠科和白饭树属的基因组数据较少，特别缺少高质量的染色体水平基因组。该研究首次组装了染色体水平的白饭树的单倍型基因组，单倍体A和单倍体B，大小分别为487.33 M和477.53 Mb。此外，在单倍体A和单倍体B基因组中分别预测了21,587和21,533个蛋白质编码基因。
柬埔寨龙血树和白饭高质量基因组的完成，为揭示其重要农艺性状的形成提供了重要的基础数据，并为药用植物基因组学和保护基因组学研究提供了重要参考。
原文链接：https://doi.org/10.1038/s41597-024-03670-w
https://doi.org/10.1038/s41597-024-03681-7
