本站消息 近日，学校动物科学技术学院赵桂英教授团队在Nature子刊《Scientific Data》（JCR Q1，IF5 years=8.9）及《DNA Research》先后发表题为“Comprehensive visceral transcriptome profiling of three pig breeds along altitudinal gradients in Yunnan”和“Integrative transcriptomic analysis reveals alternative splicing complexity and transcriptomic diversity in porcine placentas across altitudes”的研究论文。该研究通过系统构建不同海拔梯度特色猪种心、肝、脾、肺、肾及胎盘等多组织转录组全景图谱，采用整合生物信息学分析方法，首次阐释了可变剪接事件通过调控转录组多样性影响地方猪种高原环境适应的分子机制。
氧稳态的维持是多细胞生物生存的重要生物学基础，机体通过精密调控基因表达网络以适应低氧微环境，从而保障细胞存活及组织正常发育。云南复杂的垂直气候梯度孕育了丰富的地方猪种质资源，为高原低氧适应性研究提供了理想的大型哺乳动物模型。值得关注的是，可变剪接作为一种重要的转录后调控机制，可动态调控动物生长发育及生理代谢等关键生物学进程，通过选择性剪接异构体的生成赋予组织细胞转录组与蛋白质组功能多样性。然而，可变剪接在高原家畜低氧适应中的分子调控机制仍不明确。
研究团队通过系统整合长读长Iso-seq和短读长RNA-seq测序技术，成功构建了不同海拔梯度地方猪种的多组织全长转录组及可变剪接图谱。研究揭示了高海拔与低海拔猪种在转录组的多样性、可变剪接的复杂性等方面的显著差异特征，鉴定了IGF1、MECOM、HIF1A、HSPA8等参与低氧适应性调控的关键功能基因。该研究成果不仅为地方猪种抗逆性优良种质资源的分子育种提供了新路径，同时为其他哺乳动物高原低氧适应机制的研究提供了借鉴。
学校为论文第一署名单位，动物科学技术学院赵桂英教授为两篇论文的通讯作者，霍金龙教授与研究生李昌尧分别为两篇论文的第一作者。该研究得到了云南省科技厅重大科技专项“云南地方猪种业创新研究与应用”（202302AE090016）和国内外十余家科研机构与高等院校的鼎力支持。
论文链接：
Scientific Data: https://doi.org/10.1038/s41597-025-05070-0
DNA Research: https://academic.oup.com/dnaresearch/article/32/3/dsaf008/8154087?searchresult=1
